Las cuencas de los Ríos Limarí y Choapa se encuentran ubicadas en la Región de Coquimbo, ambas cuencas fluyen desde la Cordillera hacia el Océano Pacifico.

La cuenca del río Limarí, está conformada, de norte a sur, por los ríos Hurtado, Grande y Cogotí. Posee una superficie aproximada de 11.800km2, existiendo tres obras hidráulicas de relevancia como es el caso del Embalse Recoleta, La Paloma y Cogotí. Teniendo como particularidad del sistema, el alto grado de interconexión dentro de la cuenca y sus embalses. Presentando otras particularidades, como el trasvasije del agua del sistema a otras cuencas.

La cuenca del río Choapa, posee una superficie aproximada de 7.800 km2; en el límite sur de la Región de Coquimbo colindando con la Región de Valparaíso. Sus ríos principales el Río Illapel y el Río Choapa, del cual recibe el nombre la cuenca. Dentro de las obras de infraestructura, están los embales Quillayes y Corrales.